Academic Bibliography

 Search 200 years of publications by Ghent University researchers.
Advanced search
1 file | 32.80 MB
Add to list
  1. Search results
  2. Inference and evolutionary significan...

Inference and evolutionary significance of ancient polyploidy in plants

Hengchi Chen (UGent)
(2025)
Author
Promoter
(UGent)
Organization
Abstract
Polyploïdie is alomtegenwoordig, maar slechts weinigen kunnen op de lange termijn overleven. Een groot aantal studies heeft adaptieve veranderingen op genomisch, cellulair en fysiologisch niveau onthuld die evolutionaire voordelen bieden aan polyploïden, maar de factoren die bijdragen aan hun langetermijnsucces blijven grotendeels onbegrepen. Methodologische beperkingen en het ontbreken van een uitgebreide fylogenetische basis vormen de belangrijkste obstakels. In mijn proefschrift presenteer ik mijn onderzoeksvoortgang in het verbeteren van huidige methoden voor de reconstructie en datering van oude polyploïdie, evenals het uitvoeren van een grootschalige fylogenomische studie waarin 132 oude polyploïdie-evenementen werden geïdentificeerd en gedateerd. Deze studie onthult dat oude polyploïdie-evenementen niet willekeurig langs de tijdlijn verspreid waren, maar geclusterd waren rond periodes van grote milieuschommelingen, met name het PETM en de K-Pg-grens. Tot slot tonen we, door meerdere bewijslijnen te integreren, aan dat polyploïden een grotere kans hebben om te overleven tijdens periodes van grote milieuturmoil.
Polyploidy abound, but only a few can survive in the long term. A large body of studies have revealed adaptive changes at the genomic, cellular, and physiological levels that confer evolutionary advantages to polyploids, but the factors contributing to their long-term success remain poorly understood. Methodological constraints and the lack of a comprehensive phylogenetic framework are the major hurdles. In my PhD dissertation, I present my research progress in advancing current methods for the inference and dating of ancient polyploidy, and carrying out a large-scale phylogenomic study that identified and dated 132 ancient polyploidy events, revealing that ancient polyploidy events were not randomly distributed along the timeline, but clustered around periods of great environmental upheaval, particularly the PETM and K-Pg boundary. In the end, integrating multiple lines of evidence, we show that polyploids have an increased chance of survival during times of great environmental turmoil.
Keywords
WGD, Polyploidy, Plants, Genome Evolution

Downloads

  • Download
    (...).pdf
    • full text (Published version)
    • |
    • UGent only (changes to open access on 2028-02-21)
    • |
    • PDF
    • |
    • 32.80 MB

Citation

Please use this url to cite or link to this publication:

MLA
Chen, Hengchi. Inference and Evolutionary Significance of Ancient Polyploidy in Plants. Ghent University. Faculty of Sciences, 2025.
APA
Chen, H. (2025). Inference and evolutionary significance of ancient polyploidy in plants. Ghent University. Faculty of Sciences, Ghent, Belgium.
Chicago author-date
Chen, Hengchi. 2025. “Inference and Evolutionary Significance of Ancient Polyploidy in Plants.” Ghent, Belgium: Ghent University. Faculty of Sciences.
Chicago author-date (all authors)
Chen, Hengchi. 2025. “Inference and Evolutionary Significance of Ancient Polyploidy in Plants.” Ghent, Belgium: Ghent University. Faculty of Sciences.
Vancouver
1.
Chen H. Inference and evolutionary significance of ancient polyploidy in plants. [Ghent, Belgium]: Ghent University. Faculty of Sciences; 2025.
IEEE
[1]
H. Chen, “Inference and evolutionary significance of ancient polyploidy in plants,” Ghent University. Faculty of Sciences, Ghent, Belgium, 2025.
@phdthesis{01JNZX49QNC1QV60B8WTNJ5K3V,
  abstract     = {{Polyploïdie is alomtegenwoordig, maar slechts weinigen kunnen op de lange termijn overleven. Een groot aantal studies heeft adaptieve veranderingen op genomisch, cellulair en fysiologisch niveau onthuld die evolutionaire voordelen bieden aan polyploïden, maar de factoren die bijdragen aan hun langetermijnsucces blijven grotendeels onbegrepen. Methodologische beperkingen en het ontbreken van een uitgebreide fylogenetische basis vormen de belangrijkste obstakels. In mijn proefschrift presenteer ik mijn onderzoeksvoortgang in het verbeteren van huidige methoden voor de reconstructie en datering van oude polyploïdie, evenals het uitvoeren van een grootschalige fylogenomische studie waarin 132 oude polyploïdie-evenementen werden geïdentificeerd en gedateerd. Deze studie onthult dat oude polyploïdie-evenementen niet willekeurig langs de tijdlijn verspreid waren, maar geclusterd waren rond periodes van grote milieuschommelingen, met name het PETM en de K-Pg-grens. Tot slot tonen we, door meerdere bewijslijnen te integreren, aan dat polyploïden een grotere kans hebben om te overleven tijdens periodes van grote milieuturmoil.}},
  author       = {{Chen, Hengchi}},
  keywords     = {{WGD,Polyploidy,Plants,Genome Evolution}},
  language     = {{eng}},
  pages        = {{XII, 252}},
  publisher    = {{Ghent University. Faculty of Sciences}},
  school       = {{Ghent University}},
  title        = {{Inference and evolutionary significance of ancient polyploidy in plants}},
  year         = {{2025}},
}