@phdthesis{01J9RBHBF536Z3BFVGEAQ3GSS6,
  abstract     = {{Mijn thesis richt zich op het gebruik van CRISPR-technologie om genetische veranderingen aan te brengen in Arabidopsis thaliana, een modelplant in de plantkunde. In mijn onderzoek bestudeer ik hoe CRISPR/Cas9 gebruikt kan worden om meerdere genen in Arabidopsis tegelijk uit te schakelen om zo op grote schaal genetische interacties te kunnen ontdekken. Genetische interactie treedt op wanneer mutaties in meerdere genen samen (in één plant) een effect veroorzaken dat anders is dan wat verwacht zou worden op basis van de afzonderlijke effecten van die mutaties. Om deze methode te gebruiken, hebben we een programma ontwikkeld dat het vinden van specifieke doeltwit DNA-segmenten (gRNA's) voor CRISPR/Cas9 vereenvoudigt en tegelijkertijd primers ontwerpt voor PCR en sequencing, waarmee de doelgebieden geanalyseerd kunnen worden. Daarnaast heb ik onderdelen van het CRISPR/Cas9-systeem aangepast om de efficiëntie van genbewerking in de kiemlijn van Arabidopsis te verbeteren, door verschillende Cas9-promotoren (voor genexpressie) en nucleaire lokalisatiesignalen (die het Cas9-eiwit naar de celkern sturen) te vergelijken op efficiëntie. Met deze tools hebben we genetische interacties in de DA1-pathway onderzocht, een pathway die verantwoordelijk is voor de zaadontwikkeling in Arabidopsis en andere gewassen zoals rijst en maïs. We schakelden per Arabidopsis plant 3 tot 6 genen uit en vonden interacties die leiden tot grotere zaden. Dit kan belangrijk zijn voor het verhogen van de gewasopbrengst. Onze methode kan ook worden toegepast op andere pathways om genetische interacties met waardevolle eigenschappen te identificeren.}},
  author       = {{Develtere, Ward}},
  language     = {{eng}},
  pages        = {{249}},
  publisher    = {{Ghent University. Faculty of Sciences}},
  school       = {{Ghent University}},
  title        = {{Systematic identification of genetic interactions in plants using high-throughput CRISPR screens}},
  year         = {{2024}},
}